如今，叶尔羌河中下游湿地自然保护区碧波荡漾、鹭鸟成群，呈现一幅人与自然和谐共生的美丽画卷。
党的十八大以来，兵团着力推进环境风险防范、生态保护修复和生态环境治理能力建设，打好污染防治攻坚战，生态环境质量持续向好。2021年，兵团城市空气质量平均优良天数比例提升到76%。
兵团加大重点区域大气污染防治力度，推动工业企业节能增效，实施传统制造业清洁化改造，着力打好大气污染防治攻坚战。“十三五”期间，兵团淘汰煤电落后产能88.8万千瓦，完成1371万千瓦火电机组超低排放改造。截至2021年底，兵团二氧化硫、氮氧化物、化学需氧量、氨氮排放总量较2015年分别减少18%、15.1%、2.9%、5.7%。
围绕水环境质量改善目标，兵团严格落实水污染防治行动计划。2021年，兵团30个国控断面地表水优良水体比例为82.6%，城市饮用水水源水质达到或优于Ⅲ类比例达100%，城市污水处理率达到95%，31个兵团级及以上工业集聚区全部建成污水集中处理设施。
兵团深入推进农用地土壤污染防治，亩均农膜残留量持续下降，农药、化肥使用量实现负增长，畜禽粪污综合利用率达到87.76%，规模养殖场粪污处理设施配套率达到98.41%。
兵团稳步推进实施退耕还林、退牧还草、退地减水等重大生态修复工程，湿地和物种栖息地得到有效保护。截至目前，兵团森林覆盖率达到19.2%，蓄积量超过3500万立方米，草原综合植被盖度达到42.6%，已建立面积超过16万公顷的各级各类自然保护地22处、湿地自然保护区4处，设立国家级湿地公园6处。
